Home Salud Recolección de muestras de sangre del cordón y medición de DNAm —Bio-101

Recolección de muestras de sangre del cordón y medición de DNAm —Bio-101

by notiulti

Recolectamos muestras de sangre entera de la sangre del cordón umbilical dentro de los 30 minutos posteriores al parto por parte del personal de investigación, como se describió anteriormente. [21]. A continuación, las muestras se dividieron en alícuotas (300-500 µL / alícuota) y se almacenaron a -80 ° C. La concentración de ADN bicatenario se evaluó utilizando el kit de ensayo Quant-iT ™ PicoGreen ™ dsDNA Assay (Qiagen, EE. UU.) Después de la extracción de ADN utilizando el All Prep DNA / RNA / Protein Mini Kit (Qiagen, EE. UU.). Los niveles de metilación a> 850.000 loci CpG se cuantificaron utilizando Infinium MethylationEPIC BeadChip después de la conversión de bisulfito de sodio [21]. El preprocesamiento se realizó utilizando el minfi Paquete R [26]. Eliminamos las sondas que no son CpG, sondas que se anotaron en los cromosomas sexuales, sondas que mostraron una detección no significativa (pag valor> 0,05) en ≥ 5% de las muestras, sondas con un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) con una frecuencia alélica menor ≥ 5% en la CpG diana o en la extensión de una sola base, así como sondas de reacción cruzada informadas en [27]. Usamos la función ComBat en el todos Paquete R para tener en cuenta los efectos por lotes [28]. Conservamos un total de 790,563 sondas de alta calidad para análisis estadísticos.

Nota: El contenido anterior se extrae automáticamente de un artículo de investigación y es posible que no se muestre correctamente.

You may also like

Leave a Comment

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.