Home Mundo Análisis de genes expresados ​​diferencialmente relacionados con el desarrollo de miocardiopatía diabética en el miocardio de ratas diabéticas tipo 2

Análisis de genes expresados ​​diferencialmente relacionados con el desarrollo de miocardiopatía diabética en el miocardio de ratas diabéticas tipo 2

by notiulti

Fondo

La miocardiopatía diabética (MCD) contribuye a la mortalidad de los pacientes con diabetes tipo II (DM2). Sin embargo, el mecanismo molecular de DCM permanece sin aclarar.

Resultados

El presente estudio analizó los genes expresados ​​diferencialmente (DEG) relacionados con la aparición y desarrollo de DCM. Además, se establecieron modelos animales de rata T2DM con diferentes cursos de DCM, y estos fueron confirmados por los resultados de la prueba de tolerancia oral a la glucosa (OGTT), el examen del perfil de glucosa y lípidos en sangre y los resultados de la ecocardiografía M. Luego, se utilizó la secuenciación del transcriptoma para cribar los genes relacionados con DCM. Un total de 18.410 genes y 19.184 unigenes en cada grupo obtuvieron la anotación Gene Ontology (GO). Los resultados del análisis bioinformático revelaron que había 360 DEG en el grupo 8w-T2DM, incluidos 191 genes regulados positivamente y 169 genes regulados negativamente, y 381 DEG en el grupo 16w-T2DM, incluidos 258 genes regulados positivamente y 123 genes regulados negativamente. Los DEG se enriquecieron en 19 componentes celulares, 21 funciones moleculares y 22 procesos biológicos. Los resultados del análisis de la vía KEGG revelaron que en el grupo 8w-T2DM, los DEG estaban enriquecidos en las vías de biosíntesis de ácidos grasos insaturados, señalización de PPAR y elongación, degradación y metabolismo de ácidos grasos. En los grupos de 16w-T2DM, las vías que enriquecieron los DEG involucrados fueron el procesamiento y presentación de antígenos, cascadas de complemento y coagulación, moléculas de adhesión celular (CAM) y miocarditis viral. Los genes regulados positivamente fueron los siguientes: Cers1, Acot1, Hmgcs2, NTSR-1, PDK4 y Cxcl13. Los genes regulados negativamente fueron los siguientes: Abcd2 y Fcrl-2. Estos se identificaron como correlacionados con la aparición y el desarrollo de DCM. La expresión diferencial se validó mediante cadena de polimerasa cuantitativa (Q-PCR).

Conclusiones

Cers1, el gen involucrado en el metabolismo de los lípidos, tenía el valor Log2FC más alto y podría considerarse el gen relacionado con DCM para una investigación adicional. Esto podría ayudar a detectar el objetivo farmacéutico potencial de DCM.

Palabras clave

Cardiomiocito diabético, secuenciación del transcriptoma, genes expresados ​​diferencialmente, anotación GO, vía KEGG, validación Q-PCR

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